结核日重磅发布 | temNGS-MycTB助力结核精准诊疗
难治的结核
结核病是最难对付的传染病之一,世界卫生组织将每年3月24日定为“世界预防结核病日”。
全球范围内,2020年估计有990万人新感染结核,其中以非洲和东南亚感染人数最多,平均每10万人分别有336人和303人感染。其他地区感染者同样较2019年有所增加。另外,多重耐药性结核占比高达26.8%。
传统结核检测方法存在的挑战
结核的检测技术可大致分为两类,一类是直接检测,包括:痰培养、涂片镜检、结核菌素实验(PPD)、核酸检测等;一类是间接检测,包括:X射线照射、γ干扰素释放试验(IGRA)等。这些方法往往存在特异性及灵敏度较低、实验周期较长等缺点。
因此临床需要一种快速、全面且能指导用药的新型检测方法。
temNGS-MycTB助力结核精准检测
碳华检测自主研发的靶向富集宏基因组测序(target enrichment metagenomics Next Generation Sequencing, temNGS)技术,结合靶向富集和宏基因组测序,提高病原微生物检测灵敏度。
基于temNGS,我们推出temNGS-MycTB,能有效解决结核分枝杆菌检出率低的问题,覆盖大部分结核分支杆菌,区分非结核分支杆菌和麻风分枝杆菌,增加检测结果准确性。temNGS-MycTB覆盖1500个耐药位点,并可同时检测其他未知病原感染。
- 全面检测结核杆菌感染情况。
- 筛查耐药位点和其他未知病原感染。
- 从提取到出报告,最快16小时完成。
01、耐药基因检测情况
temNGS-MycTB检测覆盖一线药物(利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等),二线药物(氟喹诺酮类、阿卡米星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、乙硫异烟胺、环丝氨酸等)、新药(贝达喹啉、氯法齐明、利奈唑胺、德拉马尼德)以及对氨基水杨酸、氨基糖苷类等结核相关结核药物相关的1500个位点。
耐药基因检测列表 |
||
药物类型 |
耐药基因 |
|
一线药物 |
利福平 |
rpoB等2个 |
异烟肼 |
katG等5个 |
|
吡嗪酰胺 |
pncA等3个 |
|
乙胺丁醇 |
embB等4个 |
|
二线药物 |
氟喹诺酮类 |
gyrA等2个 |
阿卡米星 |
rrs |
|
卡那霉素 | eis等2个 | |
卷曲霉素 |
tlyA等2个 |
|
链霉素 |
rpsL等3个 |
|
乙硫异烟胺 |
ethA等4个 |
|
环丝氨酸 |
alr |
|
新药 |
贝达喹啉、氯法齐明 |
Rv0678 |
利奈唑胺 |
rplC等2个 |
|
德拉马尼德 |
fgd1等3个 |
|
其它 |
对氨基水杨酸 |
ribD等4个 |
氨基糖苷类 |
rrs |
02、临床样本检测结果展示
对部分临床样本进行检测后,temNGS-MycTB能准确对分枝杆菌进行种属鉴定、分型,并检测出耐药位点,下表展示了其中两例结核阳性样本的检测结果。
2个临床样本检测结果展示 |
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检测情况 |
样本1 |
样本2 |
分枝杆菌属物种鉴定 |
结核分枝杆菌 |
结核分枝杆菌 |
主分型 |
lineage1 |
lineage2 |
亚分型 |
lineage1.2.1.2.1 |
lineage2 |
耐药结论 |
Sensitive |
Other |
耐药突变位点数 |
0 |
1 |
其它突变位点数 |
38 |
56 |
利福平 |
- |
- |
异烟肼 |
- |
- |
吡嗪酰胺 |
- |
- |
乙胺丁醇 |
- |
- |
链霉素 |
- |
rrs_n.888G>A |
氟喹诺酮类 |
- |
- |
莫西沙星 |
- |
- |
氧氟沙星 |
- |
- |
左氧氟沙星 |
- |
- |
环丙沙星 |
- |
- |
氨基糖苷类 |
- |
- |
卡那霉素 |
- |
- |
卷曲霉素 |
- |
- |
乙硫异烟胺 |
- |
- |
对氨基水杨酸 |
- |
- |
环丝氨酸 |
- |
- |
利奈唑胺 |
- |
- |
贝达喹啉 |
- |
- |
氯法齐明 |
- |
- |
免费试用征集
如果您是结核防治领域的专家,对temNGS-MycTB感兴趣,欢迎通过以下任一方式与我们联系,获取免费试用资格:
将您的联系方式、研究/临床背景,发送至邮箱:infection@icxivd.com ;
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